SIBO traitement : quels sont les meilleurs antibiotiques ?

  • Jan 9, 2026

SIBO traitement : quels sont les meilleurs antibiotiques ?

  • Joris Vanlerberghe
  • SIBO
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SIBO : quel antibiotique choisir ? Analyse d’une étude française comparant antibiotique unique et rotation pour améliorer la rémission du SIBO.

Le traitement du SIBO (Small Intestinal Bacterial Overgrowth) repose historiquement sur les antibiotiques, mais aucune recommandation internationale claire ne définit le protocole optimal.

Une étude française publiée en 2021 dans le United European Gastroenterology Journal s’est intéressée à une question clé en pratique clinique : faut-il privilégier une rotation de plusieurs antibiotiques plutôt qu’un seul antibiotique ?

Cet article analyse en détail les résultats de cette étude, ses implications cliniques et ses limites.


Qu’est-ce que le SIBO et pourquoi son traitement pose problème ?

Le SIBO correspond à une augmentation anormale de la charge bactérienne dans l’intestin grêle.

Il est associé à des symptômes digestifs peu spécifiques :

  • Ballonnements

  • Douleurs abdominales

  • Diarrhée ou constipation

  • Sensation de digestion lente

Le diagnostic repose principalement sur des tests respiratoires non invasifs, notamment le test respiratoire au glucose, utilisé dans cette étude.

Malgré la fréquence du SIBO, aucun antibiotique n’a d’autorisation officielle spécifique, et les stratégies thérapeutiques varient fortement selon les centres et les pays.


Objectif de l’étude

L’objectif principal de l’étude était d’évaluer :

  • L’efficacité d’un antibiotique unique

  • Versus une rotation d’antibiotiques (quinolone + azolé)

pour obtenir une rémission du SIBO, définie par la normalisation du test respiratoire au glucose après traitement.


Méthodologie de l’étude

Type d’étude

  • Étude rétrospective monocentrique

  • Réalisée au CHU de Rouen

  • Période : 2005 à 2020

Population étudiée

  • 223 patients avec un test respiratoire au glucose positif

  • Âge moyen : 50 ans

  • Près de 80 % de femmes

Diagnostic du SIBO

Le SIBO était diagnostiqué à l’aide d’un test respiratoire au glucose 75 g, avec mesure de l’hydrogène (H₂) et du méthane (CH₄), selon les critères du consensus nord-américain.


Protocoles antibiotiques comparés

Antibiotique unique

  • Soit un azolé (métronidazole ou ornidazole)

  • Soit une quinolone (norfloxacine, ciprofloxacine ou ofloxacine)

Antibiotiques en rotation

  • Alternance mensuelle sur 3 mois :

    • Un azolé

    • Puis une quinolone

  • Chaque antibiotique administré 10 jours par mois


Résultats principaux

Taux de rémission du SIBO

  • 53,4 % de rémission après traitement antibiotique global

  • 70,0 % de rémission avec antibiotiques en rotation

  • 50,8 % de rémission avec un antibiotique unique

La différence atteint la significativité statistique.

Comparaison directe des stratégies thérapeutiques

traitement antibiotique SIBO

Image provenant de l'étude : Richard N. et al. The effectiveness of rotating versus single course antibiotics for small intestinal bacterial overgrowth. United European Gastroenterology Journal, 2021


Effets sur les symptômes digestifs

La rémission du SIBO était associée à :

  • Une amélioration significative de la qualité de vie digestive

  • Une diminution significative des ballonnements

En revanche :

  • Pas d’amélioration nette de la douleur

  • Pas d’amélioration significative de la diarrhée ou de la constipation

Ces résultats suggèrent que le ballonnement est le symptôme le plus directement lié à l’éradication bactérienne dans le SIBO.


Effet sur les gaz intestinaux (H₂ et CH₄)

Après traitement :

  • Diminution significative des pics d’hydrogène et de méthane

  • Effet particulièrement marqué avec les antibiotiques en rotation, notamment sur le méthane

Cela est cohérent avec l’hypothèse d’une meilleure couverture des flores anaérobies et méthanogènes par la rotation antibiotique.


Récidive du SIBO

  • Faible taux de rechute global

  • Pas de différence statistiquement significative entre les groupes

  • Délai moyen de rechute :

    • Plus court après rotation

    • Mais nombre de cas trop faible pour conclure


Pourquoi la rotation semble plus efficace ?

Les auteurs avancent plusieurs hypothèses :

  • Spectre antibactérien plus large

  • Action complémentaire :

    • Quinolones : bactéries Gram négatif

    • Azolés : bactéries anaérobies et microaérophiles

  • Meilleure action sur les flores mixtes retrouvées dans le SIBO

Le taux de rémission observé avec la rotation est proche de celui rapporté avec la rifaximine, sans en avoir le coût élevé.


Limites de l’étude

Plusieurs limites importantes doivent être soulignées :

  • Étude rétrospective

  • Absence de groupe placebo

  • Peu de données sur l’observance

  • Questionnaires symptomatiques disponibles chez seulement 25 % des patients

  • Forte représentation de pathologies associées comme la sclérodermie systémique

Ces éléments imposent une interprétation prudente des résultats.


Conclusion

Chez les patients atteints de SIBO, un traitement antibiotique en rotation alternant azolé et quinolone semble plus efficace qu’un antibiotique unique pour obtenir une rémission biologique, avec un bénéfice clinique principalement sur les ballonnements.

Ces résultats renforcent l’intérêt d’une approche thérapeutique plus ciblée et plus large sur le plan microbiologique, tout en rappelant l’absence actuelle de recommandations officielles standardisées.


Référence scientifique

Richard N. et al. The effectiveness of rotating versus single course antibiotics for small intestinal bacterial overgrowth. United European Gastroenterology Journal, 2021

Joris Naturopathe

À propos de l'auteur

Je suis Joris Vanlerberghe, naturopathe spécialisé dans les troubles digestifs et Auteur.

J’accompagne les personnes qui souffrent de troubles fonctionnels intestinaux comme le syndrome de l’intestin irritable (colopathie fonctionnelle), SIBO, IMO, dyspepsie ainsi que les personnes qui souffrent de maladies
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